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機轉深潛層 · 來自 Williams Hematology 拆解筆記 034006_globin-gene-clusters

珠蛋白基因簇


血紅蛋白基因調控概論

  • 任何特定年齡產生的人類 Hb 數量和類型 ← 單個珠蛋白 (globin) 鏈編碼基因的選擇性表達決定
  • 珠蛋白基因位置(見 Fig. 34.6):
    • 2 個簇位置
    • α-樣基因:16 號染色體短臂,約 30 kb DNA (kilobases)(p13.2 與端粒 (telomere)** 間)
    • β-樣基因:11 號染色體短臂末端,約 70 kb DNA(p15)

珠蛋白基因組織特徵

基本結構

  • 每個基因共享某些基本組織特徵
  • 3 個外子 (exon) 分隔 2 個內子 (intron):
    • α-基因的內子:小(100~300 bp (base pair))
    • 非 α-基因的內子:一個小 + 一個大(1000~1200 bp)
  • 第二外子:編碼珠蛋白基團結合袋的主要成分
  • 第三外子:編碼 α 與非 α 接觸點

調控序列—啟動子、增強子、沉默子

側翼序列

  • 每個基因 5' 和 3' 端側翼:保守核苷酸群
    • 與蛋白因子結合 → 促進基因轉錄
    • 確保轉錄物的保真度及其可轉譯性
    • 指定轉譯起始和終止位點
    • 改善新合成 mRNA 的穩定性(見 Fig. 34.7)

剪接訊號

  • 基因內編碼訊號 = 允許核內酶 (nuclear enzyme) 機制精確切除內子 (intron)** 和 連接外子 (exon) 形成連續『成熟』mRNA**
  • 剪接訊號位置:
    • 外子-內子結點
    • 內子內
  • 保留對剪接 (splicing) 過程至關重要**
  • 發生在剪接訊號位點內突變 → 珠蛋白合成常受損
  • mRNA 末端處理:
    • 5' 末端:帽結構 (cap structure)
    • 3' 末端:多(A) 尾 (poly(A) tail)
    • 詳見第 1 章及第 4 章

啟動子

  • 保守核苷酸簇位於 5' 至珠蛋白基因編碼部分:聚合形成啟動子 (promoter)(見 Fig. 34.7)
  • 珠蛋白啟動子:模組化 (modular)
    • 某些模組位於 mRNA 轉譯起始位點相對靠近
    • 某些更遠距排置
  • 啟動子 → 最終形成 RNA 聚合酶 (RNA polymerase) 複合體結合位點
    • 催化基因轉錄
  • 啟動子內突變:可影響基因轉錄水準 → ↓ 珠蛋白合成量

增強子與沉默子

  • 圍繞且位於每個基因內/周圍的序列元素:重要角色在其轉錄調節
  • 簇稱 增強子 (enhancer) 和 沉默子 (silencer)(見第 1 章)
    • 位置:內子內,或 5' 和 3' 編碼序列外
    • 有時:距離基因相當遠
  • DNA 在色質 (chromatin) 中的高階結構**:可允許遠程增強子在轉錄期間空間接近基因
    • 透過形成環將遠距離序列空間帶到一起
  • 增強子:對珠蛋白基因表達的組織特異性 (tissue-specific) 調節重要
  • 代表性珠蛋白基因附近的調控序列見 Fig. 34.6(類增強子元件)
  • 珠蛋白基因控制元素詳細描述如下

α-樣珠蛋白基因簇

基因組織與順序

  • α-樣和 β-樣珠蛋白基因:
    • 在 5' 到 3' 方向以相同序列排列
    • 在胚胎、胎兒和成人發育期間表達的相同序列
  • 此排列的功能意義:不確定
  • 證據建議:ε, γ, δ, β 基因的排列可能是重要因素,影響每個位點 在不同發育階段與遠距離控制元件相互作用的能力

ζ-珠蛋白基因(HBZ)

  • 僅在胚胎發育 (embryonic development) 極早期表達
  • 參與胚胎 (embryonic) Hb 的形成

μ-珠蛋白基因(HBM)

  • α 樣珠蛋白基因
  • 原始認為假基因 (pseudogene) (ψα2)
  • 編碼 141 個氨基酸 (amino acid) α-珠蛋白樣鏈
  • 在紅系 (erythroid) 細胞高度調節表達
  • 相關蛋白尚未發現

α-珠蛋白基因(HBA2, HBA1)

  • 複製 (duplication)(雙份)
  • 編碼氨基酸序列相同 → 僅產生單一 α-珠蛋白多肽
  • 細微差異:第二介入 (intron)** 序列 + 3' 側翼區
    • 允許識別各基因的轉錄物
  • 表達效率:
    • 5' 或 α_2 基因 > 3' 或 α_1 基因
    • 此基因異常 → 臨床更明顯

Θ-珠蛋白基因(HBQ1)

  • α-基因簇 3' 至 α_1 基因
  • 神祕元素 (mysterious element)(作用尚不明確)
  • Θ-基因轉錄物在胎兒組織與成人紅系 (erythroid) 骨髓中發現
    • 不清楚此基因轉譯 (translation) 產物是否能參與功能四聚體形成
  • Θ-珠蛋白:在體內已發現
  • Θ-珠蛋白基因刪除:似乎對發育中胎兒無影響
  • 體外 (in vitro):
    • Θ-珠蛋白 mRNA 正確剪接
    • Θ-珠蛋白 cDNA 可引導可轉譯 mRNA 及 Θ-珠蛋白蛋白的合成

β-樣珠蛋白基因簇

胚胎期基因

  • ε-基因 (HBE):
    • 僅於生命第 1~11 週轉錄

胎兒期基因—γ-珠蛋白

  • 複製 γ-珠蛋白基因 (HBG2, HBG1):
    • 編碼胎兒生活的主導非 α-珠蛋白
  • 編碼序列:完全相同,除了密碼子 (codon) 136**:
    • 5' 或 Gγ-基因 → 編碼麩氨酸 (glutamic acid)
    • 3' 或 Aγ-基因 → 編碼丙氨酸 (alanine)
  • 表達不相等:胎兒發育期間
    • 表達相對速率變化 → 相似成人 Gγ 和 Aγ 鏈數量差異
  • Gγ/Aγ 轉變:
    • 基因表達控制的觀點有趣
    • 臨床意義少
  • 胎兒和成人中 HbF:
    • 含混合 Gγ 和 Aγ 鏈
    • 這些 Hb 的功能特質相同

成人期基因—δ 和 β-珠蛋白

  • δ 和 β-珠蛋白基因:
    • 可能來自40 百萬年前的複製 (duplication) 事件
  • β-珠蛋白基因:成為主導基因
    • 編碼成人大多數非 α-珠蛋白鏈
  • δ-珠蛋白基因:
    • 啟動子在多個關鍵區域已發生突變 (mutation)
    • 表達大幅受限
    • 其產物:成人 Hb 的少量分數 (HbA_2)
    • 因極低 RBC 水準,功能上無關緊要
  • δ-珠蛋白基因似為『進化中的假基因 (pseudogene)』
  • 臨床用處:HbA_2 對描述血紅蛋白病有用,如 β-地中海貧血 (beta thalassemia)

假基因

  • 假基因 (pseudogene) 分散在珠蛋白基因簇內**:
    • 提供進化歷史有趣一瞥
  • 假基因:先前表達基因的無活性 (inactive) 遺跡
  • 鬆弛選擇 (relaxed selection) 結果 → 變異速率 > 圍繞活性基因
    • δ-珠蛋白基因表達可能完全廢止 = 當它獲得失活 (inactivating) 突變**

珠蛋白基因表達調控

組織和分化特異性

  • 人類珠蛋白基因表達高度調節
  • 迄今為止:珠蛋白僅思考在一個組織合成——紅系細胞 (erythroid cell)
    • 僅在紅系祖細胞 (erythroid progenitor) 分化的狹隘定義階段
    • 5~7 天:起點為原紅母細胞 (proerythroblast) 階段,終點為無核網織紅球 (enucleated reticulocyte) 失去最後 RNA 跡象
  • 最近發現:少量 α-珠蛋白表達 = 在內皮 (endothelial) 的肌內皮結合**
    • 此處存在可能涉及 NO 對血管張力 (vascular tone) 調節**
  • 組織特異性和分化階段特異性邊界內:
    • 珠蛋白基因 = 紅細胞中極度活躍
    • 晚期正常母細胞 (late normoblast) 和網織紅球階段**:
      • 90~95% 所有蛋白質合成 = 珠蛋白合成

發育階段特異性表達

  • 個別珠蛋白基因在人類胚胎 (embryonic)、胎兒 (fetal) 和『成人』(37~38 週孕期及以後)發育中紅母細胞 (erythroblast)** 不同水準表達
  • 不同珠蛋白基因子集 = 在每個發育階段表達和沉默
  • 重要特徵:非 α-珠蛋白、α-珠蛋白和珠蛋白基團產生的整體平衡 = 在這些複雜轉變事件期間維持
  • 複雜機制 = 確保適當的組織特異性、分化階段特異性和本體論 (ontogeny) 階段特異性表達**:
    • 不完全定義
    • 許多相關 DNA 控制元件和轉錄因子 (transcription factor) 的資訊正出現
    • 話題在本體論 Hb 複查後討論

血紅蛋白轉變圖(Hemoglobin Switching)

  • ζ 和 ε 基因:於胚胎發育期間轉錄,很快被胎兒 (fetal) γ-珠蛋白和成人 α-珠蛋白基因替代
  • 出生時:
    • HbF(胎兒 Hb)≈ 75% 總 Hb
    • HbA ≈ 25%
  • γ-基因轉錄:於出生前開始↓,6 個月年齡時僅非常低水準表達
  • δ-珠蛋白基因表達:於出生附近開始
  • 成人:
    • HbA ≈ 97% 總 Hb
    • HbA_2 ≈ 2.5%
    • HbF < 1%(見 Fig. 34.8)

珠蛋白基因簇的進化起源

  • α-樣和 β-樣珠蛋白基因簇:
    • 可能源自原始珠蛋白基因的古代複製 (duplication)
    • 存在於脊椎動物 (vertebrate) 早期歷史(≈ 500 百萬年前)
  • 每個基因簇:可能源自祖先 (ancestral) 基因複製及隨後進化eons期間的分歧 (divergence)

See Also

  • ← 返回第 034 章
  • Hemoglobin Synthesis, Structure, and Function
  • Ontogeny of Hemoglobin
  • Hemoglobin Biosynthesis and Its Regulation
  • Enzymes of Red Blood Cell Intermediary Metabolism
  • Therapy of Essential Thrombocythemia
  • Pathobiology of Essential Thrombocythemia